RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF149Q8NC42 400 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAD54LQ92698 747 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A087X0B3 334 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAPSQ13938 189 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCM6Q14566 821 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMX1Q9H3N1 280 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR182O15218 404 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNJ6P48051 423 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEFB103AP81534 67 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDILTQ8N807 584 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFCAB14O75071 495 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 BSNDQ8WZ55 320 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 GBF1Q92538 1859 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH11P35749 1972 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 TFDP1Q14186 410 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARSHQ5FYA8 562 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ODR4Q5SWX8 454 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPBP1Q86WP2 473 aa23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENPP3O14638 875 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 HIP1RO75146 1068 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAT6P42226 847 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHKA2P46019 1235 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 DAW1Q8N136 415 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIFAP3Q92845 792 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK17AQ9UEE5 414 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 MGEA5O60502 916 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 GUCY2CP25092 1073 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTENP60484 403 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAPK7Q13164 816 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 RESP18Q5W5W9 173 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 SFI1A8K8P3 1242 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC9A7Q96T83 725 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCND2Q9NZV8 630 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 AMHP03971 560 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 RABGGTBP53611 331 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 POU5F1BQ06416 359 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADALQ6DHV7 355 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFT74Q96LB3 600 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 DRC1Q96MC2 740 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAM2Q99965 735 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 DENND3A2RUS2 1198 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX58Q96C10 678 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRCH3Q96II8 777 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 REEP2Q9BRK0 252 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIPINQ9BVW5 301 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC3P53804 2025 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 UPP2O95045 317 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PBX2P40425 430 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAMPTP43490 491 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PEX3P56589 373 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 DSC3Q14574 896 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP2R5AQ15172 486 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 E2F4Q16254 413 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 SV2BQ7L1I2 683 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms