RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 CTNNB1P35222 781 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 TFDP1Q14186 410 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 PTPROQ16827 1216 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 BRAPQ7Z569 592 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 FERMT3Q86UX7 667 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 PLVAPQ9BX97 442 aa22.11■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 H3BNC9 293 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 SKIP12755 728 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 PHKA2P46019 1235 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 FAM189BP81408 668 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 KSR1Q8IVT5 923 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.1■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 EYSQ5T1H1 3165 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 BMPR1AP36894 532 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 GPM6BQ13491 265 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 RNF149Q8NC42 400 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.09■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 A0A0U1RQF3 1178 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 EOMESO95936 686 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 BMP15O95972 392 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 FGFR4P22455 802 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 POU5F1BQ06416 359 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 KRT79Q5XKE5 535 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 POTEGQ6S5H5 508 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 ABI1Q8IZP0 508 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 AAASQ9NRG9 546 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 THEGQ9P2T0 379 aa22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CMTM3-211ENST00000565922 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 RAB27AP51159 221 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 P2RX5Q93086 422 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.07■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ERLIN2O94905 339 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 LINC00271P0C7V0 271 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ARL2P36404 184 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 SNX21Q969T3 373 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.06■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 PTENP60484 403 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 MYH11P35749 1972 aa22.05■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 AXLP30530 894 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 GATMP50440 423 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 PADI6Q6TGC4 694 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 HSCBQ8IWL3 235 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 LRRC43Q8N309 656 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 RNF169Q8NCN4 708 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.04■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 FGFR1P11362 822 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 CAPSQ13938 189 aa22.03■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CMTM3-211ENST00000565922 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.03■■□□□ 1.12
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