RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	LARGE1	O95461	756 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	NPEPPS	P55786	919 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	KSR1	Q8IVT5	923 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	EFHB	Q8N7U6	833 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF558	Q96NG5	402 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PPP4C-208	ENST00000564966	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM205C	A6NFA0	338 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PER2	O15055	1255 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	TBX3	O15119	743 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	MBTPS2	O43462	519 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PBX3	P40426	434 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF410	Q86VK4	478 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	LXN	Q9BS40	222 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0U1RQF3	1178 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	ZP2	Q05996	745 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	EPHA7	Q15375	998 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	LONRF3	Q496Y0	759 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	HAS1	Q92839	578 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP89	Q96ST8	783 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CHST12	Q9NRB3	414 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF19A	Q9NV58	838 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	EOMES	O95936	686 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	ALAD	P13716	330 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CA8	P35219	290 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	ERVFC1	P60507	584 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP4A11	Q02928	519 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	KRT17	Q04695	432 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	DYDC2	Q96IM9	177 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	RGL1	Q9NZL6	768 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PPM1A	P35813	382 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM143	Q96AN5	459 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	TCF25	Q9BQ70	676 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	JAK2	O60674	1132 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	XKR9	Q5GH70	373 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	TPH2	Q8IWU9	490 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	SPG21	Q9NZD8	308 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	RFC5	P40937	340 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PHKA2	P46019	1235 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CALCRL	Q16602	461 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	TMC7	Q7Z402	723 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	LPP	Q93052	612 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CLEC1B	Q9P126	229 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	LZTS1	Q9Y250	596 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-208	ENST00000564966	BTBD18	B2RXH4	712 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SKI	P12755	728 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	PLCB3	Q01970	1234 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	C4orf19	Q8IY42	314 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	FSD2	A1L4K1	749 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	DCX	O43602	365 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR37L1	O60883	481 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP2B1	P20020	1258 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12

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