RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 EP400Q96L91 3159 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAF1P21675 1872 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 NPHP1O15259 732 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 NTSR2O95665 410 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 INSRRP14616 1297 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 MX1P20591 662 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP4F3Q08477 520 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF827Q17R98 1081 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 PARP10Q53GL7 1025 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTC22Q5TAA0 569 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 BVESQ8NE79 360 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYT3Q9BQG1 590 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 NARFQ9UHQ1 456 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1B0GUL6 1792 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 SGSM2O43147 1006 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDE8AO60658 829 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 THBDP07204 575 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 THBS2P35442 1172 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDE1AP54750 535 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 TFCP2Q12800 502 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 INF2Q27J81 1249 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC24Q50LG9 513 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 AACSQ86V21 672 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 APBA2Q99767 749 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 GREM2Q9H772 168 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLSCR1O15162 318 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRP5O75197 1615 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL4A1P02462 1669 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAM17P78536 824 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 RILPL2Q969X0 211 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABCC12Q96J65 1359 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR20Q99678 358 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 PALD1Q9ULE6 856 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CACNA1SQ13698 1873 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF609O15014 1411 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 EYA2O00167 538 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDC45O75419 566 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CSF1RP07333 972 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 SDSP20132 328 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC6A11P48066 632 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNNI3KQ59H18 835 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q8N1Y9 231 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 KYQ8NBH2 561 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 FRS2Q8WU20 508 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms