RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ABHD16A	O95870	558 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ITGB1	P05556	798 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	KCNA6	P17658	529 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	FNTB	P49356	437 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	DYDC2	Q96IM9	177 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MAML3	Q96JK9	1138 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	WDR92	Q96MX6	357 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	WDR26	Q9H7D7	661 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	NPTXR	O95502	500 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	PTPA	Q15257	358 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	BRAP	Q7Z569	592 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	KIF11	P52732	1056 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	NCDN	Q9UBB6	729 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	STC2	O76061	302 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	SPIDR	Q14159	915 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	ST8SIA2	Q92186	375 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	DVL2	O14641	736 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	B3GALT2	O43825	422 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	PPFIA4	O75335	1185 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	GNAT2	P19087	354 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	NPEPPS	P55786	919 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	TTC38	Q5R3I4	469 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	NBPF4	Q96M43	638 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	ZAR1L	A6NP61	321 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	MASP2	O00187	686 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	DAPK3	O43293	454 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	HK1	P19367	917 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	KIR2DL3	P43628	341 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	RASA3	Q14644	834 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	CSRP2	Q16527	193 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	TOR3A	Q9H497	397 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843		M0R2C6	588 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM24	O15164	1050 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	C21orf58	P58505	322 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	MYBPC3	Q14896	1274 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	ACSS2	Q9NR19	701 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	MTSS1	O43312	755 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	KCNQ2	O43526	872 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	RECQL4	O94761	1208 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	BCAR1	P56945	870 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS2-205	ENST00000558843	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49

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