RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALCAMQ13740 583 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNJ12Q14500 433 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHDC9Q8NEP7 349 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 BSNDQ8WZ55 320 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNC93B1Q9H1C4 597 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL1A2P08123 1366 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE4BO95155 1302 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 CBFA2T2O43439 604 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOXD13P35453 343 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCKAP1LP55160 1127 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTP1P59025 263 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPFIA1Q13136 1202 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 LHX8Q68G74 356 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCP11Q8WWU5 503 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.96■□□□□ 0.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 KAT6AQ92794 2004 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDXKO00764 312 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP2R5AQ15172 486 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNA10Q16322 511 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCP11X2Q5H9J9 407 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 METTL13Q8N6R0 699 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARRDC4Q8NCT1 418 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDLIM2Q96JY6 352 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACCSQ96QU6 501 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIFC3Q9BVG8 833 aa18.95■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 HAS3O00219 553 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPM3P06753 285 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASGR1P07306 291 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARL2P36404 184 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 IER5Q5VY09 327 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXR2Q6PJQ5 311 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPC24Q8NBT2 197 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 RETREG2Q8NC44 543 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRA6Q9BX79 667 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF208Q9H0X6 261 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM206Q9H813 350 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 HTTP42858 3142 aa18.94■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLIC2O15247 247 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGEB2O15479 319 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R37O75864 691 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYCP01106 439 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCL5P13501 91 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNM2P50570 870 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GTF2BQ00403 316 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAM9Q13443 819 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT31Q15323 416 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTFR1Q15390 333 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRIK4Q16099 956 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 FILIP1LQ4L180 1135 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 IRF2BP1Q8IU81 584 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GBP3Q9H0R5 595 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 NRCAMQ92823 1304 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 DENND3A2RUS2 1198 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLRA2P23416 452 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR2F2P24468 414 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLRC1P26715 233 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 DRP2Q13474 957 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 C7orf31Q8N865 590 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEPTORQ8TB45 409 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS16Q9H269 839 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 IKZF4Q9H2S9 585 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.93■□□□□ 0.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms