RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	WNT7A	O00755	349 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	HIP1R	O75146	1068 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	IL18RAP	O95256	599 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	NT5C1B	Q96P26	610 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	STRA6	Q9BX79	667 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0G2JMZ2	1700 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	NCAN	O14594	1321 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SMIM22	K7EJ46	135 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	CETP	P11597	493 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	FMO5	P49326	533 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	HOOK3	Q86VS8	718 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	GPD1L	Q8N335	351 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	STAM	Q92783	540 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	PLIN2	Q99541	437 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	VTA1	Q9NP79	307 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF302	Q9NR11	478 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RAB21	Q9UL25	225 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	VAMP7	P51809	220 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	KRT39	Q6A163	491 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	EXTL3	O43909	919 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	ATG7	O95352	703 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SLC1A1	P43005	524 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	CUL1	Q13616	776 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	EMB	Q6PCB8	327 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	BBOF1	Q8ND07	529 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RUFY1	Q96T51	708 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF233	A6NK53	670 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1R37	O75864	691 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	ECE1	P42892	770 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	GTF2A2	P52657	109 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SPP2	Q13103	211 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	PAK2	Q13177	524 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	KIF22	Q14807	665 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	CFAP58	Q5T655	872 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	NSMF	Q6X4W1	530 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	FAM107B	Q9H098	131 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	GCNT4	Q9P109	453 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	KPNA6	O60684	536 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RARRES1	P49788	294 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RPS6KA1	Q15418	735 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	STIL	Q15468	1287 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	RAB17	Q9H0T7	212 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	GAN	Q9H2C0	597 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	CPVL	Q9H3G5	476 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	AMFR	Q9UKV5	643 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM23-233	ENST00000557667	ERVK-24	P63145	666 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM23-233	ENST00000557667	GCNT1	Q02742	428 aa		9.21	□□□□□ -0.94

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