RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 KCNH7Q9NS40 1196 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ANKEF1Q9NU02 776 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SFI1A8K8P3 1242 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 WDR64B1ANS9 1081 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 H0YCG3 227 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MAFGO15525 162 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ZMYND10O75800 440 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MYBL2P10244 700 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 TNFAIP3P21580 790 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 PSMC5P62195 406 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MAPK7Q13164 816 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MTMR1Q13613 665 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MTMR3Q13615 1198 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 TKFCQ3LXA3 575 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 CFAP58Q5T655 872 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MAATS1Q7Z4T9 603 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 CD302Q8IX05 232 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 BANK1Q8NDB2 785 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SCFD2Q8WU76 684 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 KRT12Q99456 494 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 FAM107BQ9H098 131 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ISCUQ9H1K1 167 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 C17orf75Q9HAS0 396 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 PGAP2Q9UHJ9 254 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ZNF536O15090 1300 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ANKRD62A6NC57 917 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 TMCO5BA8MYB1 307 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 CEP104O60308 925 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ITGB5P18084 799 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GBP1P32455 592 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 RARRES1P49788 294 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 VAMP7P51809 220 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SMTNP53814 917 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 UBXN2AP68543 259 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GTF2BQ00403 316 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SLC7A5Q01650 507 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GUCY2DQ02846 1103 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 KCNA1Q09470 495 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MS4A14Q96JA4 679 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SYT11Q9BT88 431 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 CARD9Q9H257 536 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 EPB41L5Q9HCM4 733 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GOLGA6L10A6NI86 522 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 AGPSO00116 658 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 WNT10BO00744 389 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 PHACTR2O75167 634 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 STAM2O75886 525 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GGPS1O95749 300 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ALAS1P13196 640 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 CCND2P30279 289 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 YWHABP31946 246 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GTF2H1P32780 548 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 OAZ1P54368 228 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GALCP54803 685 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 NCKAP1LP55160 1127 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SKOR1P84550 965 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 SPDYCQ5MJ68 293 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 DCAF15Q66K64 600 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 MIGA2Q7L4E1 593 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 OTUD6AQ7L8S5 288 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 DAAM2Q86T65 1068 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 NLRX1Q86UT6 975 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 NT5DC3Q86UY8 548 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-205ENST00000546891 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms