RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM27	P14373	513 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CD40	P25942	277 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM17	P78536	824 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	GBX1	Q14549	363 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ACAP2	Q15057	778 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CLUL1	Q15846	466 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	EMC4	Q5J8M3	183 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	STEAP3	Q658P3	488 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD1	Q719H9	257 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	RUNDC1	Q96C34	613 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SARG	Q9BW04	601 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	MSRA	Q9UJ68	235 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	INVS	Q9Y283	1065 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	KRIT1	O00522	736 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	AGXT	P21549	392 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	C5AR1	P21730	350 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SDHA	P31040	664 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHA5	P54756	1037 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHA7	Q15375	998 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CT83	Q5H943	113 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	WIZ	O95785	1651 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ACOT7	O00154	380 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ERC2	O15083	957 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	VCAM1	P19320	739 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFRSF1A	P19438	455 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ENPP1	P22413	925 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	MTNR1B	P49286	362 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	FNTB	P49356	437 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	TUSC3	Q13454	348 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	TOR2A	Q5JU69	321 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	IL31	Q6EBC2	164 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNK18	Q7Z418	384 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PJA1	Q8NG27	643 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX11	Q96FC9	970 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ACAP3	Q96P50	834 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ANO3	Q9BYT9	981 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308		A6NNZ2	444 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	APAF1	O14727	1248 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	AP1G1	O43747	822 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP2C8	P10632	490 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	OSM	P13725	252 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	GJA4	P35212	333 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC6A11	P48066	632 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	NEK3	P51956	506 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	BRD3	Q15059	726 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO41	Q8TF61	875 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	TAAR9	Q96RI9	348 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	MYOT	Q9UBF9	498 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57

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