RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DACT1	Q9NYF0	836 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	HIDE1	A8MVS5	230 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TEC	P42680	631 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	KCNC3	Q14003	757 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	NPY5R	Q15761	445 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	INF2	Q27J81	1249 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TMC7	Q7Z402	723 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SUSD6	Q92537	303 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	KCNH6	Q9H252	994 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CHST12	Q9NRB3	414 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		18.04	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777		A0A087WZ62	844 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	FBXL18	Q96ME1	805 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	S1PR5	Q9H228	398 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		18.03	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TECTA	O75443	2155 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PHKA2	P46019	1235 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PSMC5	P62195	406 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ZXDA	P98168	799 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	LETM2	Q2VYF4	491 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF410	Q86VK4	478 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	APOL5	Q9BWW9	433 aa		18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	18.02	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM221	A6NGB7	291 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777		M0R296	226 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	EML1	O00423	815 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	SLC37A4	O43826	429 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	BCAR1	P56945	870 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	ANO5	Q75V66	913 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	SKI	P12755	728 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	CA8	P35219	290 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	PPP2R5C	Q13362	524 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	LONRF3	Q496Y0	759 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	KSR1	Q8IVT5	923 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	CASP10	Q92851	521 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	LPP	Q93052	612 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM169	Q96HH4	297 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	FAM20A	Q96MK3	541 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	NLRP4	Q96MN2	994 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		18	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	CDKL5	O76039	1030 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	CXCL14	O95715	111 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	XBP1	P17861	261 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	NPEPPS	P55786	919 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	NHLH1	Q02575	133 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	SCRN1	Q12765	414 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	NEK8	Q86SG6	692 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	VAV3	Q9UKW4	847 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		17.99	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	17.98	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	17.98	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	17.98	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	17.98	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	RAB27A	P51159	221 aa		17.98	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		17.98	■□□□□ 0.47
DDX11-222	ENST00000542777	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		17.98	■□□□□ 0.47

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