RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 C17orf50Q8WW18 174 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 BACH1O14867 736 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MCM7P33993 719 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KCNQ4P56696 695 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NDUFA5Q16718 116 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC93Q567U6 631 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CARD9Q9H257 536 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NOD2Q9HC29 1040 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 DSEQ9UL01 958 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQC6 194 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 KLC1Q07866 573 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 ZNF280DQ6N043 979 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 HIC2Q96JB3 615 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NDE1Q9NXR1 346 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GGT7Q9UJ14 662 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TBX3O15119 743 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM63Q969Q1 353 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 MCF2LO15068 1137 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 RHOBTB3O94955 611 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KCNA3P22001 575 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KIF11P52732 1056 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF543Q08ER8 600 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ZFATQ9P243 1243 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 USP17L3A6NCW0 530 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 USP17L4A6NCW7 530 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 GHRP10912 638 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ERMNQ8TAM6 284 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CEP95Q96GE4 821 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 DPH5Q9H2P9 285 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 I3L4J1 428 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 APBA3O96018 575 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CPP00450 1065 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 OATP04181 439 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MLH1P40692 756 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CABP7Q86V35 215 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 SEPT3Q9UH03 358 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 USP11P51784 963 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 PTPROQ16827 1216 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 KRT79Q5XKE5 535 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 BHMTQ93088 406 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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