RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	NEMF	O60524	1076 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	IRS1	P35568	1242 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	RFC5	P40937	340 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	CWH43	Q9H720	699 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	CHST12	Q9NRB3	414 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPME1	Q9Y570	386 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	FGF18	O76093	207 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	LAG3	P18627	525 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATP2B1	P20020	1258 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	TXK	P42681	527 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	XKR9	Q5GH70	373 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMEM143	Q96AN5	459 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRJ-206	ENST00000534219	EOMES	O95936	686 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	C8orf34	Q49A92	452 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	LRRC43	Q8N309	656 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	C8orf76	Q96K31	380 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	RNF19A	Q9NV58	838 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM50B	Q9Y247	325 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	WNT7A	O00755	349 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZBTB39	O15060	712 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLITRK3	O94933	977 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	LTBR	P36941	435 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBE3A	Q05086	875 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	CLUL1	Q15846	466 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	NCOR1	O75376	2440 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	LINC01565	O15544	149 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	EMC2	Q15006	297 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	TCP11	Q8WWU5	503 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	TLR9	Q9NR96	1032 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	WDR81	Q562E7	1941 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	MCM7	P33993	719 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	PHKA2	P46019	1235 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	NRIP1	P48552	1158 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	NDUFV1	P49821	464 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF558	Q96NG5	402 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTR	Q99707	1265 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	SKI	P12755	728 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	PBX3	P40426	434 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADAM15	Q13444	863 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	LONRF3	Q496Y0	759 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTMR9	Q96QG7	549 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIF2C	Q99661	725 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	CD320	Q9NPF0	282 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ERVFC1	P60507	584 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	GJD3	Q8N144	294 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	TLE6	Q9H808	572 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRJ-206	ENST00000534219	ASAP2	O43150	1006 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	TBX10	O75333	385 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLCB3	Q01970	1234 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	KRT17	Q04695	432 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	EFHB	Q8N7U6	833 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	RNF149	Q8NC42	400 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	LPP	Q93052	612 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRJ-206	ENST00000534219	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		27.82	■■■□□ 2.04

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