RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532433.5

TATDN3-215, Transcript of TatD DNase domain containing 3, human

TSL 2

Gene TATDN3, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TATDN3-215	ENST00000532433	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	LZTS1	Q9Y250	596 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	SPTBN2	O15020	2390 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	SGSM2	O43147	1006 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	DDAH1	O94760	285 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	S1PR4	O95977	384 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	EPCAM	P16422	314 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	FGFR4	P22455	802 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CLCN3	P51790	818 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	TTC22	Q5TAA0	569 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	MAP4K1	Q92918	833 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	HIP1	O00291	1037 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	PRC1	O43663	620 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	ZNF862	O60290	1169 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	LAG3	P18627	525 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	TRAF1	Q13077	416 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	DRP2	Q13474	957 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	NME8	Q8N427	588 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CUL5	Q93034	780 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	ANO3	Q9BYT9	981 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	HBP1	O60381	514 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	MTMR3	Q13615	1198 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	UGCG	Q16739	394 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CEP55	Q53EZ4	464 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	LENG9	Q96B70	501 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	RMDN1	Q96DB5	314 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CEP89	Q96ST8	783 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	ZBP1	Q9H171	429 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TATDN3-215	ENST00000532433	KRBA1	A5PL33	1030 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433		M0QZ92	97 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	MAFG	O15525	162 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	SREBF1	P36956	1147 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	COL1A2	P08123	1366 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TATDN3-215	ENST00000532433	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69

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