RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF149Q8NC42 400 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 RAD9AQ99638 391 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 DENND3A2RUS2 1198 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 UPP2O95045 317 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 FGFR4P22455 802 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 GLRA2P23416 452 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 TFDP1Q14186 410 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 STK38Q15208 465 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CALML4Q96GE6 196 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAM2Q99965 735 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CSRNP2Q9H175 543 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF576Q9H609 170 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS18Q9NS28 235 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 INSL6Q9Y581 213 aa21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 BRD1O95696 1058 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PHKA2P46019 1235 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 POU5F1BQ06416 359 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CAPSQ13938 189 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM161BQ96MY7 647 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PLIN2Q99541 437 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 LCHNA4D1U4 455 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 C9IYK1 514 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 YEATS4O95619 227 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PTENP60484 403 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SPTLC2O15270 562 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF15O94989 841 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 STAG3L1P0CL83 205 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ATL3Q6DD88 541 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CLIC6Q96NY7 704 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 YME1L1Q96TA2 773 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CHST12Q9NRB3 414 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP6R2O75170 966 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCG1P19174 1290 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 TAP1Q03518 808 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 SPECC1Q5M775 1068 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 USP49Q70CQ1 688 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 BSNDQ8WZ55 320 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 KIFAP3Q92845 792 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 EPSTI1Q96J88 318 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 GUCD1Q96NT3 240 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 DACT1Q9NYF0 836 aa21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 LINC01553A4QN01 128 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 DGKIO75912 1065 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 PLA2G4BP0C869 781 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 TXLNAP40222 546 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC12A3P55017 1021 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM189BP81408 668 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP2R5AQ15172 486 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC15Q8TF66 581 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3-208ENST00000531226 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.05■□□□□ 0.96
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