RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 USP20Q9Y2K6 914 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 CTSHP09668 335 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM60Q495X7 471 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP7D2Q96T17 732 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 ARID2Q68CP9 1835 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 GAP43P17677 238 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 TYRO3Q06418 890 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNA1Q09470 495 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD8Q96I13 439 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 IFT74Q96LB3 600 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 RMND1Q9NWS8 449 aa25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A087WZ62 844 aa25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 K7ENM7 598 aa25.09■■□□□ 1.61
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TSNARE1-208ENST00000524325 GCNT3O95395 438 aa25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.09■■□□□ 1.61
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TSNARE1-208ENST00000524325 NLRP7Q8WX94 980 aa25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 SCLT1Q96NL6 688 aa25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 THPOP40225 353 aa25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1-208ENST00000524325 PRCPP42785 496 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 GPC3P51654 580 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 RTP1P59025 263 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 NLRP12P59046 1061 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TLE2Q04725 743 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 DEPTORQ8TB45 409 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR32O75388 356 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 NAMPTP43490 491 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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TSNARE1-208ENST00000524325 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 OSMRQ99650 979 aa25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.07■■□□□ 1.6
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TSNARE1-208ENST00000524325 FGFR4P22455 802 aa25.06■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.06■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.06■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXD13P35453 343 aa25.05■■□□□ 1.6
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TSNARE1-208ENST00000524325 NCKAP1LP55160 1127 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 PTK7Q13308 1070 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TAS1R3Q7RTX0 852 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 SPIRE2Q8WWL2 714 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 CD4P01730 458 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 IQCF3P0C7M6 154 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMD2Q13200 908 aa25.05■■□□□ 1.6
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TSNARE1-208ENST00000524325 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.05■■□□□ 1.6
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TSNARE1-208ENST00000524325 EDN1P05305 212 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC192P0DO97 292 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP2R5AQ15172 486 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TTLL13PA6NNM8 815 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 FAAP100Q0VG06 881 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX17Q15036 470 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 STX1AQ16623 288 aa25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 EVPLQ92817 2033 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TISP43B9A030 160 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.03■■□□□ 1.6
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