RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PHOX2BQ99453 314 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 STRA6Q9BX79 667 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TMX1Q9H3N1 280 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 VTA1Q9NP79 307 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF302Q9NR11 478 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.27□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 FAM187AA6NFU0 413 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 BACH1O14867 736 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ZBTB39O15060 712 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ARHGAP6O43182 974 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 HIP1RO75146 1068 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 STBD1O95210 358 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CCZ1BP86790 482 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GTF2BQ00403 316 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SP2Q02086 613 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 MAPK7Q13164 816 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 WDR78Q5VTH9 848 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ANO5Q75V66 913 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CEP170P1Q96L14 293 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GBP3Q9H0R5 595 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NDST4Q9H3R1 872 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 AZI2Q9H6S1 392 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.26□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 A0A1W2PQJ5 194 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 MAPK13O15264 365 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 COBLO75128 1261 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 LGR5O75473 907 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GGPS1O95749 300 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PGK2P07205 417 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 HOXC6P09630 235 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 RSPH10BP0C881 870 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NR2F2P24468 414 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ADORA2AP29274 412 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 RFC5P40937 340 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 STAT5BP51692 787 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NCKAP1LP55160 1127 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SREBF2Q12772 1141 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 FOXC1Q12948 553 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 LAMC2Q13753 1193 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GRB14Q14449 540 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PPP2R5AQ15172 486 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 UGCGQ16739 394 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 MORN1Q5T089 497 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF787Q6DD87 383 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 DPP9Q86TI2 863 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 DAW1Q8N136 415 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TC2NQ8N9U0 490 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 IFT74Q96LB3 600 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 FGD4Q96M96 766 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ACCSQ96QU6 501 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 FIZ1Q96SL8 496 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms