RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ABHD4Q8TB40 342 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 GAB3Q8WWW8 586 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 FATE1Q969F0 183 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 GALNT8Q9NY28 637 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ALDH2P05091 517 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PFKPQ01813 784 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 CR1LQ2VPA4 569 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRF1Q5T601 910 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 LIPIQ6XZB0 460 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0A6YYJ9 748 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 FURINP09958 794 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 WASP42768 502 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM193AP78312 1265 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 VASNQ6EMK4 673 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 GAREM2Q75VX8 874 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ALG3Q92685 438 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 WASF3Q9UPY6 502 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 HTR1BP28222 390 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR15P49685 360 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SCOCQ9UIL1 159 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 MAFGO15525 162 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 MCAMP43121 646 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 AK2P54819 239 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NKX3-2P78367 333 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SEMA5AQ13591 1074 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM26EQ8N5C1 309 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 DPF2Q92785 391 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX11Q96FC9 970 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TNIP3Q96KP6 325 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 CGRRF1Q99675 332 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 BTBD2Q9BX70 525 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 OR10A5Q9H207 317 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 GREM2Q9H772 168 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 L1RE1Q9UN81 338 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NFATC3Q12968 1075 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 LONRF1Q17RB8 773 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NPNTQ6UXI9 565 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SRLQ86TD4 932 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 HDAC10Q969S8 669 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ADI1Q9BV57 179 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 IL10RAQ13651 578 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 DTX3Q8N9I9 347 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KAT5Q92993 513 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 MYD88Q99836 296 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-205ENST00000514178 NRP2O60462 931 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms