RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 MSL2Q9HCI7 577 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 MSH6P52701 1360 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 AFF2P51816 1311 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0G2JNJ9 132 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 KIF3BO15066 747 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP6O43182 974 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 HMGCRP04035 888 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 KCNQ1P51787 676 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 SQSTM1Q13501 440 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 MOGSQ13724 837 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.87□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 AGBL4Q5VU57 503 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 Q9UFV3 132 aa6.87□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 EID1Q9Y6B2 187 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 DVL2O14641 736 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 PLSCR1O15162 318 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 FZD7O75084 574 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ACVRL1P37023 503 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 RRADP55042 308 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 PCOLCEQ15113 449 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 USP30Q70CQ3 517 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.86□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 BOCQ9BWV1 1114 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 NR2E1Q9Y466 385 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 LRP6O75581 1613 aa6.86□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 FMN1Q68DA7 1419 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 SUV39H1O43463 412 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 YY1P25490 414 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 IRF9Q00978 393 aa6.85□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 RGS12O14924 1447 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 COMTP21964 271 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 MRE11P49959 708 aa6.84□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-217ENST00000509355 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.84□□□□□ -1.31
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PDE4D-217ENST00000509355 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.83□□□□□ -1.32
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PDE4D-217ENST00000509355 CYR61O00622 381 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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PDE4D-217ENST00000509355 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 GPR135Q8IZ08 494 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 HIPK4Q8NE63 616 aa6.83□□□□□ -1.32
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PDE4D-217ENST00000509355 PHLPP1O60346 1717 aa6.83□□□□□ -1.32
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PDE4D-217ENST00000509355 APPP05067 770 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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PDE4D-217ENST00000509355 NRN1LQ496H8 165 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 CHST14Q8NCH0 376 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 CALML6Q8TD86 181 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 PREX2Q70Z35 1606 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 B4E1Z4 1266 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 M0R2C6 588 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 HIP1RO75146 1068 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 SLPIP03973 132 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ASLP04424 464 aa6.81□□□□□ -1.32
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