RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 SOD2P04179 222 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CHMLP26374 656 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CNR2P34972 360 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 PHKA2P46019 1235 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ADCY7P51828 1080 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 BCAR1P56945 870 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 KCNN1Q92952 543 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CPVLQ9H3G5 476 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.75□□□□□ -1.01
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PDE4D-210ENST00000503258 SHC2P98077 582 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 DSG1Q02413 1049 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.75□□□□□ -1.01
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PDE4D-210ENST00000503258 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 IGFLR1Q9H665 355 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 OATP04181 439 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TDGF1P13385 188 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 DSC1Q08554 894 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 LETM2Q2VYF4 491 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 UVSSAQ2YD98 709 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 FANCBQ8NB91 859 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CHST7Q9NS84 486 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 AKAP3O75969 853 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 LYPLA2O95372 231 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 PFKPQ01813 784 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 LILRA6Q6PI73 481 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CASC1Q6TDU7 716 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 URGCPQ8TCY9 931 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.74□□□□□ -1.01
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PDE4D-210ENST00000503258 SOBPA7XYQ1 873 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TBX3O15119 743 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 OFD1O75665 1012 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 GALTP07902 379 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 SP9P0CG40 484 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 PAX3P23760 479 aa8.73□□□□□ -1.01
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PDE4D-210ENST00000503258 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.73□□□□□ -1.01
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PDE4D-210ENST00000503258 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 NECTIN1Q15223 517 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 XKR3Q5GH77 459 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 LOXL4Q96JB6 756 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC69A6NI79 296 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ECI2O75521 394 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 NRLP54845 237 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.72□□□□□ -1.01
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PDE4D-210ENST00000503258 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM169Q96HH4 297 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 HIDE1A8MVS5 230 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CXCL14O95715 111 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ADH1AP07327 375 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 GNA11P29992 359 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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PDE4D-210ENST00000503258 FAM187BQ17R55 369 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ABI1Q8IZP0 508 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 PJA1Q8NG27 643 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 LENG9Q96B70 501 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.72□□□□□ -1.01
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