RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499601.2

AC008393.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC008393.1, Length 1,454 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008393.1-201ENST00000499601 SESTD1Q86VW0 696 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 BSNDQ8WZ55 320 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 MAP7D2Q96T17 732 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 CBX8Q9HC52 389 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.35■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 BICDL2A1A5D9 508 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 SMTNL1A8MU46 457 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 BECN2A8MW95 431 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 IKBKBO14920 756 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 MYBP10242 640 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 CLCN3P51790 818 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 CASP5P51878 434 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 DRP2Q13474 957 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 TFDP1Q14186 410 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 NELFBQ8WX92 580 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 HVCN1Q96D96 273 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 RBSNQ9H1K0 784 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 PHF24Q9UPV7 400 aa20.34■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 SLC16A4O15374 487 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 CCNE1P24864 410 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 GTF2BQ00403 316 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 MYL5Q02045 173 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 IQCB1Q15051 598 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 RNF214Q8ND24 703 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 KCNN1Q92952 543 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 P2RX5Q93086 422 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 STRA6Q9BX79 667 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.33■□□□□ 0.85
AC008393.1-201ENST00000499601 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 A0A1W2PQY0 241 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 PPP1R37O75864 691 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 CYP2C9P11712 490 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 CDC42EP1Q00587 391 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 ITGA7Q13683 1181 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 CAPSQ13938 189 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 CENPPQ6IPU0 288 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 DEPTORQ8TB45 409 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 AKT3Q9Y243 479 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.32■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 GJB1P08034 283 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 POU5F1BQ06416 359 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 ACCSQ96QU6 501 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 TSG101Q99816 390 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 TMEM206Q9H813 350 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.31■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 FSD2A1L4K1 749 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 DENND3A2RUS2 1198 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 TREHO43280 583 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 SGPL1O95470 568 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 EFNA5P52803 228 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 STX17P56962 302 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 TPM4P67936 248 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 LRRC63Q05C16 580 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 HIC1Q14526 733 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 LUZP1Q86V48 1076 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 RNF149Q8NC42 400 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 EVPLQ92817 2033 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 CENPFP49454 3210 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
AC008393.1-201ENST00000499601 CAPN2P17655 700 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms