RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 RMDN2Q96LZ7 410 aa12.86□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 AK8Q96MA6 479 aa12.86□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa12.86□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PICK1Q9NRD5 415 aa12.86□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 MYH13Q9UKX3 1938 aa12.86□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 FAM13AO94988 1023 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PLA2G4BP0C869 781 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ATP5DP30049 168 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ADCY7P51828 1080 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 TRAF1Q13077 416 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SGO2Q562F6 1265 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SMIM5Q71RC9 77 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PIGOQ8TEQ8 1089 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ATG4AQ8WYN0 398 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 NPHS2Q9NP85 383 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 POTEFA5A3E0 1075 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 POTEIP0CG38 1075 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 MECOMQ03112 1051 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 NPY5RQ15761 445 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 POTEGQ6S5H5 508 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 LRP10Q7Z4F1 713 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ELMO3Q96BJ8 720 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PCIF1Q9H4Z3 704 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM165Q9HC07 324 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PASKQ96RG2 1323 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 A0A1B0GVG6 124 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 GOLGA8SH3BPF8 625 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 GOLGA8MH3BSY2 632 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 NVLO15381 856 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 RTN2O75298 545 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 AGTP01019 485 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 RARAP10276 462 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 GRB10Q13322 594 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 RCN1Q15293 331 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SPOCK2Q92563 424 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 UBN1Q9NPG3 1134 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 MEGF6O75095 1541 aa12.85□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGAP42A6NI28 874 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PJA2O43164 708 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SLC37A4O43826 429 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 EXOC3O60645 756 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ECEL1O95672 775 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 RPL21P46778 160 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 CASP4P49662 377 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 FUT2Q10981 343 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ITIH4Q14624 930 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PRR16Q569H4 304 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SUSD4Q5VX71 490 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 RAD54LQ92698 747 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 IKZF4Q9H2S9 585 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 USP40Q9NVE5 1235 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 MAPK13O15264 365 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 GYG2O15488 501 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ADAMTS2O95450 1211 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 CTNNA2P26232 953 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 RPL13P26373 211 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 CETN2P41208 172 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PRPHP41219 470 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 TMED1Q13445 227 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 TLDC1Q6P9B6 456 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 CEP120Q8N960 986 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM47Q9BQJ4 181 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 THAP2Q9H0W7 228 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ANAPC5Q9UJX4 755 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 ASAP2O43150 1006 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 CSF1RP07333 972 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 FERP16591 822 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 MARCKSL1P49006 195 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SNAP25P60880 206 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 CNGA2Q16280 664 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 C6orf163Q5TEZ5 329 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 FYB2Q5VWT5 728 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SLC30A10Q6XR72 485 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 SFR1Q86XK3 245 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 UCMAQ8WVF2 138 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 EYA3Q99504 573 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 GGA2Q9UJY4 613 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa12.84□□□□□ -0.35
PRRX1-207ENST00000497230 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms