RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495705.5

LMO4-204, Transcript of LIM domain only 4, humanhuman

TSL 3

Gene LMO4, Length 565 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4-204ENST00000495705 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 PTPRSQ13332 1948 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 GLRA2P23416 452 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 SLC12A3P55017 1021 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 AMHP03971 560 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.21■■□□□ 1.15
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LMO4-204ENST00000495705 GUCY2CP25092 1073 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 CAPSQ13938 189 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 PPP2R5AQ15172 486 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 DRC1Q96MC2 740 aa22.21■■□□□ 1.15
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LMO4-204ENST00000495705 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 MYH11P35749 1972 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO4-204ENST00000495705 PTENP60484 403 aa22.2■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.142e-6■■■□□ 15.9
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LMO4-204ENST00000495705 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.2■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.2■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.2■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.2■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 MCM6Q14566 821 aa22.19■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 RESP18Q5W5W9 173 aa22.19■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 GPBP1Q86WP2 473 aa22.19■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 TMX1Q9H3N1 280 aa22.19■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.19■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 DENND3A2RUS2 1198 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 HIP1RO75146 1068 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 DEFB103AP81534 67 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 ADALQ6DHV7 355 aa22.18■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.18■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 DAW1Q8N136 415 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 PDILTQ8N807 584 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 BSNDQ8WZ55 320 aa22.17■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 CHST12Q9NRB3 414 aa22.17■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 A0A087X0B3 334 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 FGFR4P22455 802 aa22.16■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 RAB30Q15771 203 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 ARSHQ5FYA8 562 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 IQUBQ8NA54 791 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 DEPTORQ8TB45 409 aa22.16■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 PANK2Q9BZ23 570 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.16■■□□□ 1.14
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LMO4-204ENST00000495705 DACT1Q9NYF0 836 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 MGEA5O60502 916 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 ERLIN2O94905 339 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 GJB5O95377 273 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.15■■□□□ 1.14
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