RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.09■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 GPC3P51654 580 aa26.08■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.08■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.08■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SIMC1-208ENST00000495423 ADAMTS3O15072 1205 aa26.07■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 CIITAP33076 1130 aa26.07■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 RNF169Q8NCN4 708 aa26.07■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 HELQQ8TDG4 1101 aa26.07■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 WDR64B1ANS9 1081 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF862O60290 1169 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 OATP04181 439 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 EVCP57679 992 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM105Q8N8V8 129 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 LENG9Q96B70 501 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 DZANK1Q9NVP4 752 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 DACT1Q9NYF0 836 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 SAMM50Q9Y512 469 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 IRAK3Q9Y616 596 aa26.06■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF292O60281 2723 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 NBL1P41271 181 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 BCAR1P56945 870 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 FGD1P98174 961 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 PRR16Q569H4 304 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM169Q96HH4 297 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ZBP1Q9H171 429 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 C6orf50Q9HD87 102 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.05■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD1Q15327 319 aa26.04■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.04■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 USTQ9Y2C2 406 aa26.04■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 CARNS1A5YM72 827 aa26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 CXCL14O95715 111 aa26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 PRKCEQ02156 737 aa26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 CHST12Q9NRB3 414 aa26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 DISC1Q9NRI5 854 aa26.03■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 WEE2P0C1S8 567 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 FGFR4P22455 802 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 GIT2Q14161 759 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 Q6ZUG5 572 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 ASCL5Q7RTU5 278 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 VPS52Q8N1B4 723 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 SCLT1Q96NL6 688 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.02■■□□□ 1.76
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 PRR23AA6NEV1 266 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 ASGR2P07307 311 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 CTSAP10619 480 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 GNA11P29992 359 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 FOXK2Q01167 660 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 NID2Q14112 1375 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 UGCGQ16739 394 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 SLC22A17Q8WUG5 538 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 NLRP7Q8WX94 980 aa26.01■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 DCHS1Q96JQ0 3298 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 EPCAMP16422 314 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 CA8P35219 290 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 PHKA2P46019 1235 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 CLCN5P51795 746 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 CDC42EP1Q00587 391 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 RABEP1Q15276 862 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 RIT2Q99578 217 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 KIF2CQ99661 725 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 LIMD1Q9UGP4 676 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 CACNA1AO00555 2505 aa26■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 MSH4O15457 936 aa25.99■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 EDIL3O43854 480 aa25.99■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 CPA1P15085 419 aa25.99■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 SFNP31947 248 aa25.99■■□□□ 1.75
SIMC1-208ENST00000495423 JAK3P52333 1124 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms