RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 CDSNQ15517 529 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CEP68Q76N32 757 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 C1orf159Q96HA4 380 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 GMLQ99445 158 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 RBPJLQ9UBG7 517 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 MROH6A6NGR9 719 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 KLF4O43474 513 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 HOXB7P09629 217 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ECI1P42126 302 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 GRIA2P42262 883 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TGFB2P61812 414 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 FXNQ16595 210 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SLC10A6Q3KNW5 377 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 WDR63Q8IWG1 891 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 LOXL4Q96JB6 756 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CDIP1Q9H305 208 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SERPINB2P05120 415 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SCG5P05408 212 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TM4SF1P30408 202 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ST5P78524 1137 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TESK1Q15569 626 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DDR2Q16832 855 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 MROH9Q5TGP6 573 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CPZQ66K79 652 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DIO2Q92813 273 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 SAMD11Q96NU1 681 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 STK31Q9BXU1 1019 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 IL16Q14005 1332 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 H0YIN7 160 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CAMTA2O94983 1202 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 LRG1P02750 347 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ZNF853P0CG23 659 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 NAT2P11245 290 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 GFRA1P56159 465 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ZXDAP98168 799 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ICAM4Q14773 271 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TBC1D9BQ66K14 1250 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TTLL6Q8N841 843 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CNBD1Q8NA66 436 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PTPN18Q99952 460 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 NYXQ9GZU5 481 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 HYPKQ9NX55 129 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 C4AP0C0L4 1744 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TADA3O75528 432 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 HOXC12P31275 282 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DDR1Q08345 913 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 COPS6Q7L5N1 327 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 PPIL6Q8IXY8 311 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 LGI4Q8N135 537 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 Q8N1X5 172 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 TMEM169Q96HH4 297 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-240ENST00000495293 DTLQ9NZJ0 730 aa5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms