RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 LOC730098B7Z3J9 87 aa25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 MAFO75444 373 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 EOMESO95936 686 aa25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 HELQQ8TDG4 1101 aa25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 TCF25Q9BQ70 676 aa25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 CDC42EP1Q00587 391 aa25.16■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 LETM2Q2VYF4 491 aa25.16■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.16■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 CHST12Q9NRB3 414 aa25.16■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 SPG21Q9NZD8 308 aa25.16■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 VAV3Q9UKW4 847 aa25.16■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF318Q5VUA4 2279 aa25.16■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 DNM2P50570 870 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 PSMC5P62195 406 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 KSR1Q8IVT5 923 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 SUSD6Q92537 303 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 DACT1Q9NYF0 836 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 PPM1AP35813 382 aa25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 PHKA2P46019 1235 aa25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 KRT17Q04695 432 aa25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 PPP2R5CQ13362 524 aa25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 OXER1Q8TDS5 423 aa25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 S1PR5Q9H228 398 aa25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 PFKFB2O60825 505 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 NPEPPSP55786 919 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 SYCE2Q6PIF2 218 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 TMC7Q7Z402 723 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 NEK8Q86SG6 692 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF410Q86VK4 478 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 EDAQ92838 391 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 HAS1Q92839 578 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 FAM20AQ96MK3 541 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.13■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 FSD2A1L4K1 749 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 CDKL5O76039 1030 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 CTDNEP1O95476 244 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 TECP42680 631 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 LONRF3Q496Y0 759 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 LPPQ93052 612 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 STK36Q9NRP7 1315 aa25.12■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 BCAR1P56945 870 aa25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 NLRP4Q96MN2 994 aa25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 APOL5Q9BWW9 433 aa25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 FAM205CA6NFA0 338 aa25.08■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 TBX3O15119 743 aa25.08■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF623O75123 536 aa25.08■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 SRGAP2BP0DMP2 458 aa25.08■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 XBP1P17861 261 aa25.08■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM143Q96AN5 459 aa25.08■■□□□ 1.61
POLR2F-211ENST00000488684 CEP170P1Q96L14 293 aa25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms