RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PRPHP41219 470 aa29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RARRES1P49788 294 aa29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 BRAPQ7Z569 592 aa29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF149Q8NC42 400 aa29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPRSQ13332 1948 aa29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TBKBP1A7MCY6 615 aa29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 USO1O60763 962 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MED24O75448 989 aa29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SPRED2Q7Z698 418 aa29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FERMT3Q86UX7 667 aa29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MCPH1Q8NEM0 835 aa29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SNX29Q8TEQ0 813 aa29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ERLIN2O94905 339 aa29.82■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29.82■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 BMPR1AP36894 532 aa29.82■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 DSC3Q14574 896 aa29.82■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 HSCBQ8IWL3 235 aa29.82■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 C4orf32Q8N8J7 132 aa29.82■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 BMP15O95972 392 aa29.81■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM189BP81408 668 aa29.81■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 POTEGQ6S5H5 508 aa29.81■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 PLVAPQ9BX97 442 aa29.81■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa29.81■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC3P53804 2025 aa29.81■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A087WWV3 80 aa29.8■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 H3BNC9 293 aa29.8■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 EOMESO95936 686 aa29.8■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 MAEAQ7L5Y9 396 aa29.8■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa29.8■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 DNM3Q9UQ16 869 aa29.8■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.8■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A0U1RQF3 1178 aa29.79■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.79■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 ECHDC2Q86YB7 292 aa29.79■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA1024Q9UPX6 916 aa29.79■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 RAB27AP51159 221 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 NAALADL2Q58DX5 795 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 PADI6Q6TGC4 694 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 IGSF22Q8N9C0 903 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM117Q9H0C3 514 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 IFT122Q9HBG6 1241 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 FOXD4L1Q9NU39 408 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 THEGQ9P2T0 379 aa29.78■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 FGFR1P11362 822 aa29.77■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 AAK1Q2M2I8 961 aa29.77■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 CRIPAKQ8N1N5 446 aa29.77■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 PGBD4Q96DM1 585 aa29.77■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa29.77■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CCZ1B-211ENST00000486840 C5orf67F2Z3F1 127 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 LPXNO60711 386 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 GATMP50440 423 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 POU5F1BQ06416 359 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 TIGD5Q53EQ6 642 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 CHD9Q3L8U1 2897 aa29.76■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 VWA3AA6NCI4 1184 aa29.75■■■□□ 2.35
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CCZ1B-211ENST00000486840 AXLP30530 894 aa29.75■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 ARL2P36404 184 aa29.75■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM132AQ24JP5 1023 aa29.75■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 RSPH1Q8WYR4 309 aa29.75■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 IFT74Q96LB3 600 aa29.75■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 BHMT2Q9H2M3 363 aa29.75■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa29.75■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 COL4A6Q14031 1691 aa29.75■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 COL6A3P12111 3177 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 PTENP60484 403 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP2R5AQ15172 486 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC43Q8N309 656 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 P2RX5Q93086 422 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP2R3CQ969Q6 453 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 SNX21Q969T3 373 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 NT5C3AQ9H0P0 336 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 COG5Q9UP83 839 aa29.74■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 LAG3P18627 525 aa29.73■■■□□ 2.35
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP11B2P19099 503 aa29.73■■■□□ 2.35
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