RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 A0A087X0B3 334 aa36.48■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 GPR182O15218 404 aa36.48■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 CAPSQ13938 189 aa36.48■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 ODR4Q5SWX8 454 aa36.48■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 TMX1Q9H3N1 280 aa36.48■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 POLD4Q9HCU8 107 aa36.48■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 NAALADL2Q58DX5 795 aa36.47■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 RRAGBQ5VZM2 374 aa36.47■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 STK17AQ9UEE5 414 aa36.47■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 KCNJ6P48051 423 aa36.46■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 DEFB103AP81534 67 aa36.46■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 TFDP1Q14186 410 aa36.46■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 MCM6Q14566 821 aa36.46■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 FTHL17Q9BXU8 183 aa36.46■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 FGFR4P22455 802 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 GUCY2CP25092 1073 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 POU5F1BQ06416 359 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 LINC01599Q8WXQ3 324 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 BSNDQ8WZ55 320 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 KIFAP3Q92845 792 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 PANK2Q9BZ23 570 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 KCND2Q9NZV8 630 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 GBF1Q92538 1859 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 MYH11P35749 1972 aa36.45■■■■□ 3.43
CHKB-210ENST00000484266 PTENP60484 403 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 ARSHQ5FYA8 562 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 DAW1Q8N136 415 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 SLC9A7Q96T83 725 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 MINDY3Q9H8M7 445 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 GDPD2Q9HCC8 539 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 CHMP5Q9NZZ3 219 aa36.44■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 HIP1RO75146 1068 aa36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 PHKA2P46019 1235 aa36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 MAPK7Q13164 816 aa36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 RESP18Q5W5W9 173 aa36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 PDILTQ8N807 584 aa36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 TIPINQ9BVW5 301 aa36.43■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 GPBP1Q86WP2 473 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 NFKBIZQ9BYH8 718 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 GRXCR1A8MXD5 290 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 ENPP3O14638 875 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 MGEA5O60502 916 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 STAT6P42226 847 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 ADALQ6DHV7 355 aa36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 LRRIQ4A6NIV6 560 aa36.41■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 AMHP03971 560 aa36.41■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 DRC1Q96MC2 740 aa36.41■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 TTC3P53804 2025 aa36.4■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa36.4■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 NAMPTP43490 491 aa36.4■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 DSC3Q14574 896 aa36.4■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 E2F4Q16254 413 aa36.4■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 FAM13BQ9NYF5 915 aa36.4■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 PPP2R5AQ15172 486 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 CATSPER4Q7RTX7 472 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 MYOCDQ8IZQ8 938 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 IFT74Q96LB3 600 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 ADAM2Q99965 735 aa36.39■■■■□ 3.42
CHKB-210ENST00000484266 MBTD1Q05BQ5 628 aa36.38■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 HERC6Q8IVU3 1022 aa36.38■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 REEP2Q9BRK0 252 aa36.37■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 RGS18Q9NS28 235 aa36.37■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 DENND3A2RUS2 1198 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 SFI1A8K8P3 1242 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 CMA1P23946 247 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 SV2BQ7L1I2 683 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 TOP1MTQ969P6 601 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 DHX58Q96C10 678 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 C17orf75Q9HAS0 396 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 ODF2LQ9ULJ1 636 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa36.36■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 RABGGTBP53611 331 aa36.35■■■■□ 3.41
CHKB-210ENST00000484266 PEX3P56589 373 aa36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms