RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 MTMR9Q96QG7 549 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 CWH43Q9H720 699 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 AAASQ9NRG9 546 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 A0A0U1RQF3 1178 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 IL9P15248 144 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LTBRP36941 435 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 RFC5P40937 340 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 TMEM60Q9H2L4 133 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 IFT122Q9HBG6 1241 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 DACT1Q9NYF0 836 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 HOXA2O43364 376 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 MCM7P33993 719 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 ABI1Q8IZP0 508 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 CHST12Q9NRB3 414 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PPME1Q9Y570 386 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.99■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 A0A087WWV3 80 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LINC01565O15544 149 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 NCK2O43639 380 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 FGF18O76093 207 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 EOMESO95936 686 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 EMC2Q15006 297 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 HELQQ8TDG4 1101 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.98■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 MYO7AQ13402 2215 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 POTEMA6NI47 508 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LAG3P18627 525 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PBX3P40426 434 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PHKA2P46019 1235 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LONRF3Q496Y0 759 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LRRC43Q8N309 656 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 CD320Q9NPF0 282 aa20.97■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LYPLA2O95372 231 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 ERVFC1P60507 584 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 ZNF174Q15697 407 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 CLUL1Q15846 466 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 FERMT3Q86UX7 667 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 TCP11Q8WWU5 503 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LPPQ93052 612 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 MTRQ99707 1265 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.96■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 TBX10O75333 385 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 NRIP1P48552 1158 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 UBE3AQ05086 875 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 ADAM15Q13444 863 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 RNF149Q8NC42 400 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 TLR9Q9NR96 1032 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.95■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 ZNF558Q96NG5 402 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms