RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-210ENST00000477812 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SFI1A8K8P3 1242 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 MYL1P05976 194 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PLS3P13797 630 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CDC42EP1Q00587 391 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 POU5F1BQ06416 359 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NLRP4Q96MN2 994 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 FIZ1Q96SL8 496 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 A0A087WZ62 844 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 KINO60870 393 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NAMPTP43490 491 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NPTX2P47972 431 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 EHHADHQ08426 723 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 DPYDQ12882 1025 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 KANK3Q6NY19 840 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 RNF149Q8NC42 400 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 OSMRQ99650 979 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PARVGQ9HBI0 331 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 M0QZ92 97 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 KLRC4O43908 158 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NBNO60934 754 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 FAM13AO94988 1023 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 RAG1P15918 1043 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CCL23P55773 120 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PEX3P56589 373 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PTENP60484 403 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 LPIN1Q14693 890 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 POSTNQ15063 836 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PPP2R5AQ15172 486 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 KCNN1Q92952 543 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SCLYQ96I15 445 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CXCL10P02778 98 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SYN1P17600 705 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 ASIC1P78348 528 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 TFDP1Q14186 410 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 MFSD5Q6N075 450 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SFR1Q86XK3 245 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NLRP7Q8WX94 980 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 IFT74Q96LB3 600 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 GINS2Q9Y248 185 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SQORQ9Y6N5 450 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 MYH11P35749 1972 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SCN5AQ14524 2016 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 GAP43P17677 238 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PHKA2P46019 1235 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 COASYQ13057 564 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PNOCQ13519 176 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 ODR4Q5SWX8 454 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 UNC13DQ70J99 1090 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SPATA20Q8TB22 786 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 PANK4Q9NVE7 773 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CEP290O15078 2479 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 MBD3O95983 291 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 GHRP10912 638 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 IDEP14735 1019 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 RFC2P35250 354 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 NCKAP1LP55160 1127 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 FAM228AQ86W67 206 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 MYCT1Q8N699 235 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 USP38Q8NB14 1042 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-210ENST00000477812 BADQ92934 168 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms