RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TMC7Q7Z402 723 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 LRRC43Q8N309 656 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 FBXL16Q8N461 479 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TMEM105Q8N8V8 129 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 RIPOR3Q96MK2 946 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SLC26A6Q9BXS9 759 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ZBP1Q9H171 429 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 C6orf50Q9HD87 102 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SPG21Q9NZD8 308 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 DNAJB4Q9UDY4 337 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SLC37A4O43826 429 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CDC45O75419 566 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 IFNAR1P17181 557 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PHKA2P46019 1235 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MTERF2Q49AM1 385 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PLA2G4FQ68DD2 849 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 POTEGQ6S5H5 508 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ANO5Q75V66 913 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ZNF280BQ86YH2 543 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 KREMEN2Q8NCW0 462 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ETNPPLQ8TBG4 499 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TBCKQ8TEA7 893 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ADAM7Q9H2U9 754 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CEP131Q9UPN4 1083 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 H0Y858 1186 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 LILRB3O75022 631 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 OFD1O75665 1012 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 DDHD2O94830 711 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CXCL14O95715 111 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 GALTP07902 379 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CYP3A7P24462 503 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SLC11A1P49279 550 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PTPN5P54829 565 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 NPEPPSP55786 919 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 Q4G0T1 1027 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 UBXN11Q5T124 520 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 LRCH2Q5VUJ6 765 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 AGMOQ6ZNB7 445 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 IGSF21Q96ID5 467 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 FAM167AQ96KS9 214 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MAP7D2Q96T17 732 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 RIT2Q99578 217 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 IFT122Q9HBG6 1241 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 NRBP2Q9NSY0 501 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 GJB4Q9NTQ9 266 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D13Q9NVG8 400 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SAMM50Q9Y512 469 aa12.23□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 F8W810 466 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 GAS7O60861 476 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 EOMESO95936 686 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CTSAP10619 480 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 GNA11P29992 359 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 USP11P51784 963 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 KRT32Q14532 448 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ODR4Q5SWX8 454 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ASCL5Q7RTU5 278 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TAS1R1Q7RTX1 841 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 VPS52Q8N1B4 723 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 NLRP7Q8WX94 980 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CASP10Q92851 521 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TRAIPQ9BWF2 469 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TEKT3Q9BXF9 490 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 LIMD1Q9UGP4 676 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 VAV3Q9UKW4 847 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 FAM186AA6NE01 2351 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 DCHS1Q96JQ0 3298 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB39O15060 712 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 HOXA2O43364 376 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MAFO75444 373 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 EFEMP2O95967 443 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PPM1AP35813 382 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PTPN14Q15678 1187 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MIER3Q7Z3K6 550 aa12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms