RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 CELA3BP08861 270 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 LRRC41Q15345 812 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CPA6Q8N4T0 437 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 NUDT11Q96G61 164 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 TEKT5Q96M29 485 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SH3D21A4FU49 640 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TSPAN6O43657 245 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 KLHL18O94889 574 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 SCGB1D2O95969 90 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 HMGCRP04035 888 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 STAT5BP51692 787 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 NRG3P56975 720 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 MAN2A1Q16706 1144 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM240Q5SV17 173 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 MCTP2Q6DN12 878 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 GAREM2Q75VX8 874 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 PPM1NQ8N819 430 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 SPATA25Q9BR10 227 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 DNAI1Q9UI46 699 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A1B0GTL3 188 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 FFAR3O14843 346 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 IL33O95760 270 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 PF4V1P10720 104 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 VCAM1P19320 739 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 ETV4P43268 484 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 MEOX1P50221 254 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 ANO4Q32M45 955 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 Q6ZUG5 572 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 CARFQ8N187 725 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TSPEARQ8WU66 669 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 FATE1Q969F0 183 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 WDR92Q96MX6 357 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 NUAK1O60285 661 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 NDUFS2O75306 463 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 RFPL1O75677 317 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 FSBPO95073 299 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 C5AR1P21730 350 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 MGAT5Q09328 741 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 VMACQ2NL98 169 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 DAPK3O43293 454 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 MIER2Q8N344 545 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-208ENST00000472760 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms