RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	SOX10	P56693	466 aa		20.02	■□□□□ 0.8
GCFC2-208	ENST00000472230	RTP1	P59025	263 aa		20.02	■□□□□ 0.8
GCFC2-208	ENST00000472230	EMC2	Q15006	297 aa		20.02	■□□□□ 0.8
GCFC2-208	ENST00000472230	SPA17	Q15506	151 aa		20.02	■□□□□ 0.8
GCFC2-208	ENST00000472230	RDH13	Q8NBN7	331 aa		20.02	■□□□□ 0.8
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		20.02	■□□□□ 0.8
GCFC2-208	ENST00000472230	PLXNB2	O15031	1838 aa		20.02	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP4A	P20648	1035 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	GAN	Q9H2C0	597 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	GCNT4	Q9P109	453 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0U1RQJ8	604 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC9A1	P19634	815 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	PON1	P27169	355 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ABCD1	P33897	745 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	BFSP1	Q12934	665 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SPRYD7	Q5W111	196 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	BSND	Q8WZ55	320 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		20.01	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ARIH2	O95376	493 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	MORC4	Q8TE76	937 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TISP43	B9A030	160 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	AKR1B10	O60218	316 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ACTN1	P12814	892 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	FMO5	P49326	533 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM167A	Q96KS9	214 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SPAG5	Q96R06	1193 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	WDR24	Q96S15	920 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	PCYT2	Q99447	389 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		20	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	MCM3AP	O60318	1980 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	RFC5	P40937	340 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	APBA1	Q02410	837 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TTLL4	Q14679	1199 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SERPING1	P05155	500 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	KIF11	P52732	1056 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ASIC2	Q16515	512 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	GLG1	Q92896	1179 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		19.99	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	KRT86	O43790	486 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	STRN	O43815	780 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TRIM49	P0CI25	452 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TRIM49C	P0CI26	452 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	UCHL3	P15374	230 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ADORA2A	P29274	412 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ARHGAP25	P42331	645 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	MYL7	Q01449	175 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	ARMCX2	Q7L311	632 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	BICD1	Q96G01	975 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SPATA33	Q96N06	139 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		19.98	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		19.97	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	MAPK13	O15264	365 aa		19.97	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	VAMP7	P51809	220 aa		19.97	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	SCFD2	Q8WU76	684 aa		19.97	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM143	Q96AN5	459 aa		19.97	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	GPR20	Q99678	358 aa		19.97	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		19.97	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	CNGA1	P29973	690 aa		19.97	■□□□□ 0.79
GCFC2-208	ENST00000472230	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79

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