RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471165.1

CLIP4-209, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, human

TSL 2

Gene CLIP4, Length 377 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP4-209	ENST00000471165	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	MME	P08473	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	GPR19	Q15760	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PROP1	O75360	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	TOX4	O94842	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	AMY2A	P04746	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	AMY2B	P19961	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	ZNF76	P36508	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PAK2	Q13177	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	SPIDR	Q14159	915 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	KRT40	Q6A162	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	RGMA	Q96B86	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	MGST3	O14880	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PTGER1	P34995	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	NPEPPS	P55786	919 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PROK1	P58294	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CELA2A	P08217	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	RARRES1	P49788	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLIP4-209	ENST00000471165	MAST3	O60307	1309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165		H3BNC9	293 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	NTN1	O95631	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	SEC23A	Q15436	765 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	VPS72	Q15906	364 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	NTRK3	Q16288	839 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	DDB2	Q92466	427 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	ADAM2	Q99965	735 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165		B2RBV5	119 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	TP73	O15350	636 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	KRT15	P19012	456 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	ANTXR2	P58335	489 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLIP4-209	ENST00000471165	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.51	□□□□□ -1.69

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