RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 XKR9Q5GH70 373 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 POF1BQ8WVV4 589 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 NLRP4Q96MN2 994 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 CAMK1Q14012 370 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 RABEP1Q15276 862 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 EP400NLQ6ZTU2 488 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 KSR1Q8IVT5 923 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 LRRC43Q8N309 656 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 CWH43Q9H720 699 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 CLDND1Q9NY35 253 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 FAM50BQ9Y247 325 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 KIAA1671Q9BY89 1806 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 FGF18O76093 207 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 DNAJB1P25685 340 aa17.24■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 HYAL1Q12794 435 aa17.24■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 CTC1Q2NKJ3 1217 aa17.24■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 CATSPER4Q7RTX7 472 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 THNSL1Q8IYQ7 743 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 RNF169Q8NCN4 708 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 TMEM143Q96AN5 459 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 MTRQ99707 1265 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 IFT122Q9HBG6 1241 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 RNF19AQ9NV58 838 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 REV3LO60673 3130 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 GRXCR2A6NFK2 248 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 WNT7AO00755 349 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ST18O60284 1047 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ATP2B1P20020 1258 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 PHKA2P46019 1235 aa17.23■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
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NISCH-205ENST00000467594 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 LZTS1Q9Y250 596 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 KIF3AQ9Y496 699 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 CUL9Q8IWT3 2517 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 FSD2A1L4K1 749 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 CARNS1A5YM72 827 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 H3BQ06 376 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZBTB39O15060 712 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZNF623O75123 536 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 DGAT1O75907 488 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 PPM1AP35813 382 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 TRAPPC10P48553 1259 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 PLCB3Q01970 1234 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 KRT17Q04695 432 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 CLLU1OSQ5K130 101 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 LRRC55Q6ZSA7 311 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZNF558Q96NG5 402 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 TUFT1Q9NNX1 390 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 TLR9Q9NR96 1032 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 FAM105AQ9NUU6 356 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 CSPG5O95196 566 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 IRS1P35568 1242 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 LTBRP36941 435 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 POU5F1BQ06416 359 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ADAM15Q13444 863 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 TFDP1Q14186 410 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 KCNT2Q6UVM3 1135 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 RNF149Q8NC42 400 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ERMNQ8TAM6 284 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 PGBD4Q96DM1 585 aa17.21■□□□□ 0.35
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