RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465393.1

TNIK-208, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-208ENST00000465393 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.39■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.39■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 MYO7AQ13402 2215 aa22.39■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 LAD1O00515 517 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 ASAP2O43150 1006 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 MED24O75448 989 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 RPA1P27694 616 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 GATMP50440 423 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
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TNIK-208ENST00000465393 NACC1Q96RE7 527 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 RAB34Q9BZG1 259 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 CHST12Q9NRB3 414 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 DACT1Q9NYF0 836 aa22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 MUTP22033 750 aa22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PTPROQ16827 1216 aa22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 FERMT3Q86UX7 667 aa22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 THEGQ9P2T0 379 aa22.37■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 HOXA2O43364 376 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PRPHP41219 470 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PDIA5Q14554 519 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 POTEGQ6S5H5 508 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PLVAPQ9BX97 442 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 STK24Q9Y6E0 443 aa22.36■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 A0A087WWV3 80 aa22.35■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 A0A0U1RQF3 1178 aa22.35■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.35■■□□□ 1.17
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TNIK-208ENST00000465393 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.35■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.35■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 RNF149Q8NC42 400 aa22.35■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 TTC28Q96AY4 2481 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 EOMESO95936 686 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 FGFR1P11362 822 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PDCP20941 246 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 PHKA2P46019 1235 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 TFDP1Q14186 410 aa22.34■■□□□ 1.17
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TNIK-208ENST00000465393 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 ARL2P36404 184 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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TNIK-208ENST00000465393 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 P2RX5Q93086 422 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIK-208ENST00000465393 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 SKIP12755 728 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 RAB27AP51159 221 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 PTENP60484 403 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 POU5F1BQ06416 359 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 BRAPQ7Z569 592 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 ABI1Q8IZP0 508 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 RNF169Q8NCN4 708 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 AAASQ9NRG9 546 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 RNF19AQ9NV58 838 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.31■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 NCOR1O75376 2440 aa22.31■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 CAPSQ13938 189 aa22.31■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.31■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 COG5Q9UP83 839 aa22.31■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 GRM6O15303 877 aa22.3■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 ERLIN2O94905 339 aa22.3■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 GLRA2P23416 452 aa22.3■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 IL17AQ16552 155 aa22.3■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 ECM1Q16610 540 aa22.3■■□□□ 1.16
TNIK-208ENST00000465393 KRT79Q5XKE5 535 aa22.3■■□□□ 1.16
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