RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 DEPTORQ8TB45 409 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 POLD4Q9HCU8 107 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 KMT5AQ9NQR1 393 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ANO10Q9NW15 660 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 DACH1Q9UI36 760 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRIQ4A6NIV6 560 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 K7ENM7 598 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CAND2O75155 1236 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 GCNT3O95395 438 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PHKA2P46019 1235 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 EFNA5P52803 228 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 NCKAP1LP55160 1127 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 STK4Q13043 487 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 DRP2Q13474 957 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPSQ13938 189 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 SNX17Q15036 470 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 STX1AQ16623 288 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 COBLL1Q53SF7 1204 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ISM2Q6H9L7 571 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 MLKLQ8NB16 471 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF149Q8NC42 400 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRP7Q8WX94 980 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 BSNDQ8WZ55 320 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNN1Q92952 543 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 HVCN1Q96D96 273 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB10Q96DT7 871 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRP4Q96MN2 994 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 SCLT1Q96NL6 688 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TOX2Q96NM4 488 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A2Q9NP94 309 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE4BO95155 1302 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC16A4O15374 487 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 B4GALT4O60513 344 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 VTNP04004 478 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 GPC3P51654 580 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TYRO3Q06418 890 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 HAUS6Q7Z4H7 955 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CAGE1Q8TC20 777 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 FIZ1Q96SL8 496 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOC7Q9UPT5 735 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 GDAQ9Y2T3 454 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ARID2Q68CP9 1835 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WZ62 844 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 DENND3A2RUS2 1198 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 K7ERI5 159 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMA7O14818 248 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR32O75388 356 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CAVIN2O95810 425 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CD4P01730 458 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 MYBP10242 640 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 BMP6P22004 513 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 NMT1P30419 496 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 THPOP40225 353 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF445P59923 1031 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PTENP60484 403 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF2BQ00403 316 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 STRN3Q13033 797 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 BFSP2Q13515 415 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 MAPK6Q16659 721 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms