RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 XKR9Q5GH70 373 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 TTC28Q96AY4 2481 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 WNT7AO00755 349 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 DGAT1O75907 488 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 MUTP22033 750 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 GATMP50440 423 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 RAB27AP51159 221 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 KCNQ1P51787 676 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 GUCY1B3Q02153 619 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 CYP4A11Q02928 519 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 CAMK1Q14012 370 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 ABI1Q8IZP0 508 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 CASD1Q96PB1 797 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 LZTS1Q9Y250 596 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-204ENST00000462123 FGFR1P11362 822 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 MCM7P33993 719 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 FOSBP53539 338 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 EMC2Q15006 297 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 LRRC43Q8N309 656 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 NLRP4Q96MN2 994 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 MTRQ99707 1265 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 CWH43Q9H720 699 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 RNF19AQ9NV58 838 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 FSD2A1L4K1 749 aa23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 PHKA2P46019 1235 aa23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 PLCB3Q01970 1234 aa23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 FERMT3Q86UX7 667 aa23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 POF1BQ8WVV4 589 aa23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 FAM50BQ9Y247 325 aa23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 STK24Q9Y6E0 443 aa23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 OR52Z1P0C646 297 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 FGFR4P22455 802 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 KCNA5P22460 613 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 PPM1AP35813 382 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 RARRES1P49788 294 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 KSR1Q8IVT5 923 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 ERMNQ8TAM6 284 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM143Q96AN5 459 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB39O15060 712 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 FGF18O76093 207 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 ATP2B1P20020 1258 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 RPA1P27694 616 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 HYAL1Q12794 435 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 TFDP1Q14186 410 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 TTC38Q5R3I4 469 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 PGBD4Q96DM1 585 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 NACC1Q96RE7 527 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 DNAJB1P25685 340 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 AXLP30530 894 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 PTENP60484 403 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 PDIA5Q14554 519 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF174Q15697 407 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 RNF149Q8NC42 400 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 CNNM3Q8NE01 707 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC51Q96ER9 411 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 TMX3Q96JJ7 454 aa23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms