RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 DAW1Q8N136 415 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 HES6Q96HZ4 224 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 GRIN2DO15399 1336 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CLSTN1O94985 981 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CCDC172P0C7W6 258 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 MAPK7Q13164 816 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CUL1Q13616 776 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 RFFLQ8WZ73 363 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 AMACRQ9UHK6 382 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 FEM1BQ9UK73 627 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 BCS1LQ9Y276 419 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CNTNAP1P78357 1384 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CCDC188H7C350 402 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 TMEM253P0C7T8 217 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CCT5P48643 541 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 RIT2Q99578 217 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PLAAQ9Y263 795 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 KRT13P13646 458 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 TNFAIP3P21580 790 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ECHS1P30084 290 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PDCLQ13371 301 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R37O75864 691 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SKOR1P84550 965 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SAMM50Q9Y512 469 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 NCANO14594 1321 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 TISP43B9A030 160 aa22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 DLG4P78352 724 aa22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CD302Q8IX05 232 aa22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SYT11Q9BT88 431 aa22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 STRA6Q9BX79 667 aa22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 THAP2Q9H0W7 228 aa22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 PLA2G6O60733 806 aa22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 FGGP02679 453 aa22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 PALB2Q86YC2 1186 aa22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.2■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CAP2P40123 477 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 NEK9Q8TD19 979 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 COL20A1Q9P218 1284 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 EMSYQ7Z589 1322 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 NFIBO00712 420 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 HSD17B3P37058 310 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TNIP1Q15025 636 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 NAA35Q5VZE5 725 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 IL31RAQ8NI17 732 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CENPHQ9H3R5 247 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TTI1O43156 1089 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 DAPK3O43293 454 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 BCRP11274 1271 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 HSD17B4P51659 736 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 LMO3Q8TAP4 145 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ZEB2O60315 1214 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ICAM1P05362 532 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 NR1D1P20393 614 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 LRRC45Q96CN5 670 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TMEM206Q9H813 350 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 A6NNZ2 444 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 INPP5BP32019 993 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms