RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM143Q96AN5 459 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PANK4Q9NVE7 773 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 RMND1Q9NWS8 449 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE4BO95155 1302 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAH12Q6ZR08 3092 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 M0QZ92 97 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 B4GALT4O60513 344 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM13AO94988 1023 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 NPTX2P47972 431 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 MGAT3Q09327 533 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 STK4Q13043 487 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PSMD2Q13200 908 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PTK7Q13308 1070 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM26FQ5R3K3 315 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF410Q86VK4 478 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 CAGE1Q8TC20 777 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC113Q9H0I3 377 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ALPK3Q96L96 1907 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 MYH11P35749 1972 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ASAP2O43150 1006 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 GPR32O75388 356 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 CYP2C9P11712 490 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 RAG1P15918 1043 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 HOXD13P35453 343 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 DNM2P50570 870 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 GPC3P51654 580 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 CASP5P51878 434 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 GTF2BQ00403 316 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ALCAMQ13740 583 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP2R5AQ15172 486 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM26DQ5JW98 314 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ODR4Q5SWX8 454 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM102BQ5T8I3 360 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 NME8Q8N427 588 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM174Q8WUU8 243 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 HPS3Q969F9 1004 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 HVCN1Q96D96 273 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 MAP7D2Q96T17 732 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 HIPK3Q9H422 1215 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 EXOC1Q9NV70 894 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TBX21Q9UL17 535 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TANC1Q9C0D5 1861 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 EVPLQ92817 2033 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 SYCE3A1L190 88 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 SFI1A8K8P3 1242 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PIGRP01833 764 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 IDEP14735 1019 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PEX3P56589 373 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 NLRP12P59046 1061 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PTENP60484 403 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 CDC42EP1Q00587 391 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 TYRO3Q06418 890 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FAAP100Q0VG06 881 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 AMHR2Q16671 573 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM187BQ17R55 369 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM178BQ8IXR5 827 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-207ENST00000454947 ADSSL1Q8N142 457 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms