RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDXKO00764 312 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADAMTS4O75173 837 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GLRA2P23416 452 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMOD1P28289 359 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPAG1Q07617 926 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EFCAB12Q6NXP0 572 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ACCSQ96QU6 501 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM206Q9H813 350 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.73■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASAP2O43150 1006 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AP5Z1O43299 807 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HOXD13P35453 343 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 METTL13Q8N6R0 699 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DEPTORQ8TB45 409 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIM5Q9C035 493 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.72■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DENND3A2RUS2 1198 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADCY5O95622 1261 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SERPINC1P01008 464 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP1A3P13637 1013 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHMP4BP1P59074 171 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FANCCQ00597 558 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNA1Q09470 495 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TFDP1Q14186 410 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RNF180Q86T96 592 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KSR1Q8IVT5 923 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNN1Q92952 543 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP63Q96MT8 703 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GBP3Q9H0R5 595 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SETD4Q9NVD3 440 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TBX20Q9UMR3 447 aa16.71■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNJ18B7U540 433 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CBFA2T2O43439 604 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GNAT1P11488 350 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DEKP35659 375 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLCN3P51790 818 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DRP2Q13474 957 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CAPSQ13938 189 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNJ12Q14500 433 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NFIL3Q16649 462 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MARCH8Q5T0T0 291 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC01465Q8N7H1 131 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C7orf31Q8N865 590 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C2orf40Q9H1Z8 148 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CETN3O15182 167 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TGFB1I1O43294 461 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF75DP51815 510 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EFNA5P52803 228 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STRN3Q13033 797 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADAM9Q13443 819 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNA10Q16322 511 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.69■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms