RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 GATMP50440 423 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 EMC2Q15006 297 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 ERMNQ8TAM6 284 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 MTRQ99707 1265 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.5■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 ARID2Q68CP9 1835 aa23.49■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 A0A0U1RQF3 1178 aa23.49■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 LAG3P18627 525 aa23.49■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 FGFR4P22455 802 aa23.49■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.49■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 RNF169Q8NCN4 708 aa23.49■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TNFRSF10AO00220 468 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 OR52Z1P0C646 297 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 FGFR1P11362 822 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 BMP1P13497 986 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 KCNQ1P51787 676 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TTC38Q5R3I4 469 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 LRRC43Q8N309 656 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TMEM143Q96AN5 459 aa23.48■■□□□ 1.35
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LTB-211ENST00000446745 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 WNT7AO00755 349 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 DGAT1O75907 488 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 PHKA2P46019 1235 aa23.47■■□□□ 1.35
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LTB-211ENST00000446745 UBE3AQ05086 875 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TFDP1Q14186 410 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 ZNF174Q15697 407 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 KSR1Q8IVT5 923 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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LTB-211ENST00000446745 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.47■■□□□ 1.35
LTB-211ENST00000446745 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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LTB-211ENST00000446745 FERMT3Q86UX7 667 aa23.45■■□□□ 1.34
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LTB-211ENST00000446745 RNF149Q8NC42 400 aa23.45■■□□□ 1.34
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LTB-211ENST00000446745 TMX3Q96JJ7 454 aa23.45■■□□□ 1.34
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LTB-211ENST00000446745 PPM1AP35813 382 aa23.44■■□□□ 1.34
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LTB-211ENST00000446745 NACC1Q96RE7 527 aa23.44■■□□□ 1.34
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LTB-211ENST00000446745 CLDND1Q9NY35 253 aa23.44■■□□□ 1.34
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LTB-211ENST00000446745 ERLIN2O94905 339 aa23.43■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 RARRES1P49788 294 aa23.43■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 ZNF558Q96NG5 402 aa23.43■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.43■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 CWH43Q9H720 699 aa23.43■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.43■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa23.42■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 FSD2A1L4K1 749 aa23.42■■□□□ 1.34
LTB-211ENST00000446745 H3BQV1 296 aa23.42■■□□□ 1.34
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