RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARID2Q68CP9 1835 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A0A087WWV3 80 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A0A0U1RQF3 1178 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MCM7P33993 719 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.512e-7■□□□□ 9.1
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IRS1P35568 1242 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HYAL1Q12794 435 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COL19A1Q14993 1142 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LEXMQ3ZCV2 418 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 XKR9Q5GH70 373 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RNF169Q8NCN4 708 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NEK9Q8TD19 979 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 POF1BQ8WVV4 589 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PPME1Q9Y570 386 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 H3BQ06 376 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LYPLA2O95372 231 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LTBRP36941 435 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RFC5P40937 340 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EMC2Q15006 297 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF174Q15697 407 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CHST12Q9NRB3 414 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 POTEMA6NI47 508 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.513e-6■■□□□ 14.2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RABEP1Q15276 862 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IGFLR1Q9H665 355 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLDND1Q9NY35 253 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DACT1Q9NYF0 836 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.21■□□□□ 0.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EOMESO95936 686 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IL9P15248 144 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PHKA2P46019 1235 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FERMT3Q86UX7 667 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HELQQ8TDG4 1101 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AAASQ9NRG9 546 aa18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LINC01565O15544 149 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HOXA2O43364 376 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FGF18O76093 207 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PBX3P40426 434 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TECP42680 631 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NBR1Q14596 966 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LONRF3Q496Y0 759 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LPPQ93052 612 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MTRQ99707 1265 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ANKEF1Q9NU02 776 aa18.19■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ASAP2O43150 1006 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MED24O75448 989 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LAG3P18627 525 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RARRES1P49788 294 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ERVFC1P60507 584 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TTC38Q5R3I4 469 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 THNSL1Q8IYQ7 743 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABI1Q8IZP0 508 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RNF149Q8NC42 400 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TCP11Q8WWU5 503 aa18.18■□□□□ 0.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CD320Q9NPF0 282 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms