RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACP6Q9NPH0 428 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCND2Q9NZV8 630 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDR64B1ANS9 1081 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 F8VZ95 297 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF862O60290 1169 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SWSAP1Q6NVH7 229 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NLRX1Q86UT6 975 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NEK9Q8TD19 979 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STRA6Q9BX79 667 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD63C9JTQ0 380 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCP1P17987 556 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MUTP22033 750 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP8P40818 1118 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSMC5P62195 406 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCTD17Q8N5Z5 321 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 REPS2Q8NFH8 660 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BSNDQ8WZ55 320 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC102AQ96A19 550 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KLRG1Q96E93 195 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STAT1P42224 750 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NIPA1Q7RTP0 329 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CBWD2Q8IUF1 395 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP170P1Q96L14 293 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR88Q9GZN0 384 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OSGEPQ9NPF4 335 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TAS2R14Q9NYV8 317 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ESYT3A0FGR9 886 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DSG3P32926 999 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAFAH1B1P43034 410 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM193AP78312 1265 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNTN2Q02246 1040 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDR93Q6P2C0 686 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGEF19Q8IW93 802 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AS3MTQ9HBK9 375 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNK3O14649 394 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP8B1O43520 1251 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADRB2P07550 413 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRT13P13646 458 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCND2P30279 289 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOX5P35711 763 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VAMP7P51809 220 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACCSQ96QU6 501 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBXN6Q9BZV1 441 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPRC5DQ9NZD1 345 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 APEX2Q9UBZ4 518 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GHRHRQ02643 423 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TREML2Q5T2D2 321 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TEX2Q8IWB9 1127 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C4orf19Q8IY42 314 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DENND3A2RUS2 1198 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DDNO94850 711 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADSSP30520 456 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRKCIP41743 596 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPTX2P47972 431 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GALCP54803 685 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SP2Q02086 613 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MEI1Q5TIA1 1274 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EEPD1Q7L9B9 569 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VPS18Q9P253 973 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF112Q9UJU3 913 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CENPFP49454 3210 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms