RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.367e-7■□□□□ 9.6
LIMS1-208ENST00000428064 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 WASF1Q92558 559 aa23.55■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF558Q96NG5 402 aa23.55■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 EML1O00423 815 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 CTDNEP1O95476 244 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ERVFC1P60507 584 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP6Q16828 381 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.54■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WZ62 844 aa23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 FGFR4P22455 802 aa23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 KCNC3Q14003 757 aa23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 SKIP12755 728 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 AK2P54819 239 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf19Q8IY42 314 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 OXER1Q8TDS5 423 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 HAS1Q92839 578 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LIMS1-208ENST00000428064 CARNS1A5YM72 827 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 PHKA2P46019 1235 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 KRT17Q04695 432 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 EPHA7Q15375 998 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 FAM122AQ96E09 287 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 TCF25Q9BQ70 676 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 SPG21Q9NZD8 308 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 ARID2Q68CP9 1835 aa23.51■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 RAB27AP51159 221 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 POTEDQ86YR6 584 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 RNF169Q8NCN4 708 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 HELQQ8TDG4 1101 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF25Q93038 417 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 GTF3C6Q969F1 213 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 PER2O15055 1255 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF623O75123 536 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 KRT2P35908 639 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 RFC5P40937 340 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 NLRP4Q96MN2 994 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 LXNQ9BS40 222 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.49■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 NPEPPSP55786 919 aa23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 ME3Q16798 604 aa23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 RNF135Q8IUD6 432 aa23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 SUSD6Q92537 303 aa23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 CEP170P1Q96L14 293 aa23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.48■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 PBX3P40426 434 aa23.47■■□□□ 1.35
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