RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KPNA7A9QM74 516 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PEX3P56589 373 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CAV1Q03135 178 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 EXT2Q93063 718 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP72Q9P209 647 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 USP21Q9UK80 565 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CHGBP05060 677 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAD11Q709F0 780 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PROM2Q8N271 834 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DYDC2Q96IM9 177 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SYCE1LA8MT33 242 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BRJ5 948 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SRGAP2O75044 1071 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 MCF2P10911 925 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ATICP31939 592 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 BAG6P46379 1132 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM247A6NEH6 219 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PSAPP07602 524 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GPC5P78333 572 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT39Q6A163 491 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GRAMD4Q6IC98 578 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 NCLNQ969V3 563 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DACH2Q96NX9 599 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GGCXP38435 758 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF394Q53GI3 561 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RESP18Q5W5W9 173 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 THNSL1Q8IYQ7 743 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNLL2Q96FJ2 89 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS11Q9H270 941 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM160B2Q86V87 743 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SASH1O94885 1247 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PAMP19021 973 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R2AP63151 447 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP4Q96MN2 994 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SUFUQ9UMX1 484 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GLI3P10071 1580 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L3A6NCW0 530 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L4A6NCW7 530 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO5Q75V66 913 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 OR6B3Q8NGW1 331 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPH1Q92598 858 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ESYT3A0FGR9 886 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC53A6NM62 1247 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SFI1A8K8P3 1242 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 MAN1A2O60476 641 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 NFKBIAP25963 317 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CCND2P30279 289 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF207Q6ZRF8 634 aa11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms