RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423941.5

HDAC6-205, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-205ENST00000423941 PTENP60484 403 aa20.49■□□□□ 0.87
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HDAC6-205ENST00000423941 CAPSQ13938 189 aa20.49■□□□□ 0.87
HDAC6-205ENST00000423941 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.49■□□□□ 0.87
HDAC6-205ENST00000423941 GPR153Q6NV75 609 aa20.49■□□□□ 0.87
HDAC6-205ENST00000423941 SHC4Q6S5L8 630 aa20.49■□□□□ 0.87
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HDAC6-205ENST00000423941 KIFAP3Q92845 792 aa20.48■□□□□ 0.87
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HDAC6-205ENST00000423941 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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HDAC6-205ENST00000423941 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.47■□□□□ 0.87
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HDAC6-205ENST00000423941 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.47■□□□□ 0.87
HDAC6-205ENST00000423941 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.47■□□□□ 0.87
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HDAC6-205ENST00000423941 COL4A6Q14031 1691 aa20.44■□□□□ 0.86
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HDAC6-205ENST00000423941 FAM187BQ17R55 369 aa20.43■□□□□ 0.86
HDAC6-205ENST00000423941 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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HDAC6-205ENST00000423941 FZD8Q9H461 694 aa20.43■□□□□ 0.86
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HDAC6-205ENST00000423941 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.43■□□□□ 0.86
HDAC6-205ENST00000423941 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.43■□□□□ 0.86
HDAC6-205ENST00000423941 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HDAC6-205ENST00000423941 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HDAC6-205ENST00000423941 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.42■□□□□ 0.86
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