RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 SPDYE4A6NLX3 237 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 RGS20O76081 388 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CETN1Q12798 172 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 ANO5Q75V66 913 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 KSR1Q8IVT5 923 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 MMS19Q96T76 1030 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 EPC1Q9H2F5 836 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 PFASO15067 1338 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 PTPRFP10586 1907 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CBX1P83916 185 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 MYL7Q01449 175 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CREG2Q8IUH2 290 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 WDR81Q562E7 1941 aa21.99■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 F8VZ95 297 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 DGAT1O75907 488 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 STBD1O95210 358 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 TBC1D8O95759 1140 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 SOX5P35711 763 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 LBX2Q6XYB7 198 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 ARID3AQ99856 593 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 NAGPAQ9UK23 515 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 H0YCG3 227 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CBWD6Q4V339 395 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 ARID2Q68CP9 1835 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 ARID5AQ03989 594 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 VGLL4Q14135 290 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 PNKPQ96T60 521 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 LCTP09848 1927 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CES2O00748 559 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 SRGAP2O75044 1071 aa21.96■■□□□ 1.11
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SUMO3-204ENST00000411651 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.96■■□□□ 1.11
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SUMO3-204ENST00000411651 LMO3Q8TAP4 145 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CAGE1Q8TC20 777 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 TLR10Q9BXR5 811 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 TBX20Q9UMR3 447 aa21.96■■□□□ 1.11
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SUMO3-204ENST00000411651 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 FZD1Q9UP38 647 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 CSADQ9Y600 493 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-204ENST00000411651 MAP2K7O14733 419 aa21.95■■□□□ 1.1
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SUMO3-204ENST00000411651 NPTX2P47972 431 aa21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 NPEPPSP55786 919 aa21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 FAM193AP78312 1265 aa21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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SUMO3-204ENST00000411651 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CEP170P1Q96L14 293 aa21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 FUT8Q9BYC5 575 aa21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 MYH10P35580 1976 aa21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 EVI5O60447 810 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM49P0CI25 452 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM49CP0CI26 452 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ACTR2P61160 394 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 XKR3Q5GH77 459 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.94■■□□□ 1.1
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