RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBXN11Q5T124 520 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SYDE2Q5VT97 1194 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLFN13Q68D06 897 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 CNTD1Q8N815 330 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SYT8Q8NBV8 401 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GAB3Q8WWW8 586 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPATCH3Q96I76 525 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SEMA4AQ9H3S1 761 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 MS4A5Q9H3V2 200 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 HOMER2Q9NSB8 354 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRSS50Q9UI38 385 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 INVSQ9Y283 1065 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 ADAMTS20P59510 1910 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GOLGA8AA7E2F4 631 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GOLGA8BA8MQT2 603 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 NRP1O14786 923 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 DAPK3O43293 454 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 B4GALT4O60513 344 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCDH8O95206 1070 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 HOXA5P20719 270 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 STAT5BP51692 787 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC5A3P53794 718 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 WNT3AP56704 352 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANTXR2P58335 489 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 HGFACQ04756 655 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPARAQ07869 468 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 NFIXQ14938 502 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 INAVAQ3KP66 663 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 PITRM1Q5JRX3 1037 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCDC62Q6P9F0 684 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 LMBR1LQ6UX01 489 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPR155Q7Z3F1 870 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 CLEC14AQ86T13 490 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 LYSMD2Q8IV50 215 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 CXorf38Q8TB03 319 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 COG1Q8WTW3 980 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 AUTS2Q8WXX7 1259 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 RABGGTAQ92696 567 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 UIMC1Q96RL1 719 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANO3Q9BYT9 981 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC6A15Q9H2J7 730 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 KCTD10Q9H3F6 313 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 NELFAQ9H3P2 528 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 C14orf119Q9NWQ9 140 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 NR2E1Q9Y466 385 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDY2AQ9Y6F7 541 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A1W2PR48 441 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SHTN1A0MZ66 631 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 LCHNA4D1U4 455 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC26A4O43511 780 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 PHF2O75151 1096 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 JUNP05412 331 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 CLEC2LP0C7M8 214 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 VSIG10L2P0DP72 767 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GAAP10253 952 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 RBP3P10745 1247 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPS19P39019 145 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPR3P46089 330 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 MTNR1BP49286 362 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 RRADP55042 308 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SCAND1P57086 179 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 MTMR1Q13613 665 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 RNF151Q2KHN1 245 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 MUM1Q2TAK8 710 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 CT83Q5H943 113 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM180AQ6UWF9 173 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 GLB1LQ6UWU2 654 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 TAS1R1Q7RTX1 841 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 KCNK18Q7Z418 384 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 AMOTL1Q8IY63 956 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 TTC9BQ8N6N2 239 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLA2G15Q8NCC3 412 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 LMF1Q96S06 567 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SOX7Q9BT81 388 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC13A1Q9BZW2 595 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms