RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 KCNK3O14649 394 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 RNF40O75150 1001 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 FDX1P10109 184 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 LMAN1P49257 510 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 EMBQ6PCB8 327 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 RNF207Q6ZRF8 634 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 07e-51■□□□□ 8.8
PRAME-202ENST00000398743 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 RMDN3Q96TC7 470 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 GPR88Q9GZN0 384 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 JAK3P52333 1124 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 CETN1Q12798 172 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 SPP2Q13103 211 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 IFT20Q8IY31 132 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 C4orf19Q8IY42 314 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 SYCE1Q8N0S2 351 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 USP38Q8NB14 1042 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 PBKQ96KB5 322 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 PCIF1Q9H4Z3 704 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 PXMP2Q9NR77 195 aa15.05■□□□□ 0
PRAME-202ENST00000398743 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 WDR64B1ANS9 1081 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 SFNP31947 248 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GGCXP38435 758 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 NPEPPSP55786 919 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 PSMC5P62195 406 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 NSMFQ6X4W1 530 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 VWA5AO00534 786 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 BACH1O14867 736 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 VAMP7P51809 220 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GALCP54803 685 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 TNNC1P63316 161 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GTF2BQ00403 316 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 KRT76Q01546 638 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 UGCGQ16739 394 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 PEX26Q7Z412 305 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 CAVIN3Q969G5 261 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 IWS1Q96ST2 819 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 KRT12Q99456 494 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 CBWD1Q9BRT8 395 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 HACL1Q9UJ83 578 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 EMSYQ7Z589 1322 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 TISP43B9A030 160 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 NFKBIEO00221 500 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 P4HA2O15460 535 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 ATP9AO75110 1047 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GLI1P08151 1106 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 DLG4P78352 724 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 MICALL2Q8IY33 904 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 LMO3Q8TAP4 145 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 SYT11Q9BT88 431 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GDF3Q9NR23 364 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 TMEM150BA6NC51 233 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 AGPSO00116 658 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 TMEM253P0C7T8 217 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 NCKAP1LP55160 1127 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 PEX3P56589 373 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 DAAM2Q86T65 1068 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 ATG4CQ96DT6 458 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 MAPK13O15264 365 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 LRRN2O75325 713 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 CCNE2O96020 404 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 BACE1P56817 501 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 GUCY2DQ02846 1103 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 NNTQ13423 1086 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PRAME-202ENST00000398743 XKR9Q5GH70 373 aa15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms