RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 TCP11Q8WWU5 503 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 COG5Q9UP83 839 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A0U1RQF3 1178 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 ASAP2O43150 1006 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 RARRES1P49788 294 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 NBR1Q14596 966 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 P2RX5Q93086 422 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 ASB2Q96Q27 587 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 MTRQ99707 1265 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 DACT1Q9NYF0 836 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 DGAT1O75907 488 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 FERMT3Q86UX7 667 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 GRM6O15303 877 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXA2O43364 376 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MED24O75448 989 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 EOMESO95936 686 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 FGFR1P11362 822 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RPA1P27694 616 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 HLA-CQ95604 372 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF19AQ9NV58 838 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TFF2Q03403 129 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MCTP1Q6DN14 999 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ERMNQ8TAM6 284 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 NACC1Q96RE7 527 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 NCOR1O75376 2440 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A087WWV3 80 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 H3BQV1 296 aa22.92■■□□□ 1.26
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UBE2E3-201ENST00000392415 PTGDRQ13258 359 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 AAK1Q2M2I8 961 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF149Q8NC42 400 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CASD1Q96PB1 797 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 LAD1O00515 517 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGB1P05556 798 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ARL2P36404 184 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PHKA2P46019 1235 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 POU5F1BQ06416 359 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CUL4AQ13619 759 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PDIA5Q14554 519 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PTENP60484 403 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CAMK1Q14012 370 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CWH43Q9H720 699 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 AAASQ9NRG9 546 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF623O75123 536 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SKIP12755 728 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.264e-7■■■■■ 37.9
UBE2E3-201ENST00000392415 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 POTEGQ6S5H5 508 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3-201ENST00000392415 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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